Nantinya, Ahok juga ingin mengintegrasikan KRL dengan Transjakarta dan moda transportasi lainnya. Tujuan pengintegrasian ini untuk mempermudah warga melakukan pembayaran, terutama ada rute-rute transportasi massal yang dapat terintegrasi. Sehingga pembayaran tidak dilakukan berkali-kali, cukup sekali.
Namun, hingga detik ini PT KCJ yang diwakili oleh Manajer Komunikasi PT KCJ Eva Chairunisa, mengatakan kalau pengintegrasian sistem pembayaran sulit untuk dilakukan. Karena PT Transjakarta dan PT KCJ merupakan dua manajemen yang berbeda.
Namun, dengan adanya penggunaan e-tiket atau e-card. E-card yang sama bisa digunakan untuk membayar Transjakarta dan KRL.