Tim Liga Inggris lainnya, Tottenham Hotspur, juga menghadapi babak 16 besar yang tak mudah. Spurs harus menghadapi tim kuat Jerman, Borussia Dortmund. Kedua tim saat ini sama-sama menempati peringkat kedua klasemen di liga domestik masing-masing.
Satu-satunya wakil Italia di babak 16 besar, Lazio, akan menghadapi tim kuat dari Republik Ceko, Sparta Praha. Dua tim Spanyol, Athletic Bilbao dan Valencia, harus bertemu di babak ini. Sementara Villarreal akan menghadapi Bayer Leverkusen.
Berikut hasil lengkap pengundian babak 16 besar Liga Eropa:
| Shakhtar Donetsk | v | Anderlecht |
| FC Basel | v | Sevilla |
| Villarreal | v | Bayer Leverkusen |
| Athletic Bilbao | v | Valencia |
| Liverpool | v | Manchester United |
| Sparta Prague | v | Lazio |
| Borussia Dortmund | v | Tottenham |
| Fenerbahce | v | Braga |