Di game pertama, Jonatan mampu mengatasi Chou 21-18. Namun kemudian ia mengalami kekalahan 20-22 dari Chou di game kedua.
Laga berlanjut ke game penentuan, Jonatan pada akhirnya berhasil menumbangkan Chou dengan skor 21-15.
Jonatan melaju ke final setelah mengalahkan pebulutangkis Jepang Kenta Nishimoto melalui pertarungan tiga game yang berkesudahan 21-15, 15-21, dan 21-19 dalam pertandingan semifinal yang berlangsung di Istora Senayan pada Senin (27/8/2018).
Sebelumnya pada pertandingan perempat final yang berlangsung di Istora Senayan pada Minggu (26/8/2018), Jonatan menundukkan pebulutangkis Hong Kong Vincent Wong Wing Ki dua game langsung 21-11 dan 21-18.
Di babak 16 besar yang berlangsung di Istora Senayan pada Sabtu (25/8/2018), Jonatan mengatasi perlawan pebulutangkis Thailand Khosit Phetpradab dalam pertandingan yang berlangsung tiga game dengan hasil 17-21, 21-18, dan 21-18.
Jonatan melaju ke babak 16 besar dengan mengalahkan pebulutangkis Tiongkok Shi Yuqi dalam pertandingan babak 32 besar yang berlangsung di Istora Senayan pada Jumat (24/8/2018), lewat pertarungan sengit tiga game yang berkesudahan 21-19, 19-21, dan 21-17.
Keberhasilan menundukkan Chou membuat Jonatan mempersembahkan medali emas bagi Indonesia. Perolehan medali Indonesia di ajang Asian Games 2018 kini menjadi 23 emas, 17 perak, dan 28 perunggu.